Un projet After Effects est un fichier unique dans lequel sont stockées les compositions et les références à tous les métrages auxquels le projet fait appel. Les compositions sont des ensembles de calques. Si bon nombre de calques utilisent les métrages comme source, d’autres (tel est le cas des calques de forme et de texte) contiennent des graphiques créés dans After Effects. L’extension de nom d’un fichier de projet est .aep. Le nom du projet en cours s’affiche au-dessus de la fenêtre de l’application.

Un modèle de projet est un fichier dont l’extension de nom de fichier est .aet. Vous pouvez utiliser les divers modèles de projet fournis avec After Effects (notamment les modèles de menu DVD) comme base pour vos propres projets, tout comme vous pouvez créer de nouveaux modèles basés sur vos projets.

Un moyen simple de découvrir la façon dont les utilisateurs avancés travaillent avec After Effects est d’ouvrir l’un des modèles de projet fournis avec After Effects, de sélectionner tous les calques qu’il contient et d’appuyer sur U ou UU au clavier pour afficher uniquement les propriétés animées ou modifiées. Vous obtenez des indications sur les modifications que le concepteur du modèle de projet a effectuées pour créer le modèle. Il peut être utile de déverrouiller certains calques pour pouvoir les sélectionner.