Muchos ajustes de programa se almacenan en el archivo de preferencias de Adobe Photoshop CS3, incluidas las opciones generales de visualización, las opciones de guardado de archivos, las opciones de rendimiento, las opciones de cursor, las opciones de transparencia, las opciones de tipo, y las opciones de plugins y discos de memoria virtual. La mayoría de estas opciones se definen en el cuadro de diálogo Preferencias. Los ajustes de las preferencias se guardan cada vez que sale de la aplicación.

Cualquier comportamiento inesperado puede indicar que las preferencias están dañadas. Si sospecha que se han producido daños en las preferencias, restaure los ajustes por defecto de las preferencias.