Adobe Premiere Pro está diseñado para capturar, importar y editar películas y vídeo. After Effects está diseñado para generar gráficos de movimiento y efectos visuales para películas, emisiones por televisión, DVD y la Web. Puede intercambiar fácilmente proyectos, composiciones, pistas y capas entre After Effects y Adobe Premiere Pro. Puede importar a After Effects un proyecto de Adobe Premiere Pro o exportar un proyecto After Effects como proyecto de Adobe Premiere Pro. También puede importar proyectos Adobe Premiere 6.0 y 6.5 a After Effects.

Puede copiar y pegar capas y pistas entre After Effects y Adobe Premiere Pro. Si utiliza Adobe® Creative Suite® 3 Production Premium, puede utilizar Adobe Dynamic Link para exportar composiciones de After Effects a Adobe Premiere Pro o a Adobe Encore sin procesarlas primero, o bien iniciar Adobe Premiere Pro una vez dentro de After Effects y capturar material de archivo para utilizarlo en After Effects.