La velocidad de fotogramas de la composición determina el número de fotogramas que se muestran por segundo y cómo se divide el tiempo por fotogramas en la regla de tiempo y en el visualizador de tiempo. La velocidad de fotogramas de la composición suele venir determinada por el tipo de resultado deseado. Los vídeos NTSC tienen una frecuencia de fotogramas de 29,97 fotogramas por segundo (fps), los vídeos PAL tienen una frecuencia de fotogramas de 25 fps y las películas con imágenes en movimiento suelen tener una frecuencia de fotogramas de 24 fps. Según el sistema de emisión, los vídeos DVD pueden tener la misma frecuencia de fotogramas que los vídeos NTSC o PAL, o una frecuencia de fotogramas de 23,976. Los dibujos animados y vídeos diseñados para CD-ROM o para la Web, generalmente, son de 10 a 15 fps.

Si se define la frecuencia de fotogramas de la composición como dos veces la frecuencia del formato de salida, After Effects mostrará cada uno de los campos del material de archivo de origen entrelazado como un fotograma solo separado en el panel Composición. Este proceso permite definir los fotogramas clave de los campos individuales y mejorar la precisión al animar máscaras.

Cuando se procesa una película para obtener el resultado final, puede elegir entre utilizar la velocidad de fotogramas de la composición u otra velocidad de fotogramas. Esto es útil cuando se utiliza la misma composición para crear una salida para varios medios.

Todos los elementos de material de archivo de movimiento de una composición también pueden tener su propia frecuencia de fotogramas. La relación entre la velocidad de fotogramas del elemento de material de archivo y la velocidad de fotogramas de la composición determina la suavidad con la que se reproduce la capa. Por ejemplo, si la frecuencia de fotogramas del elemento de material de archivo es de 30 fps y la frecuencia de fotogramas de la composición es de 30 fps, siempre que la composición avance un fotograma, aparecerá el siguiente fotograma del elemento de material de archivo. Si la frecuencia de fotogramas del elemento de material de archivo es de 15 fps y la frecuencia de fotogramas de la composición es de 30 fps, cada fotograma del elemento de material de archivo aparece en dos fotogramas sucesivos de la composición. (Por supuesto, esto asume el caso simple en el que no se ha aplicado la expansión de tiempo o la combinación de fotogramas a la capa).

Lo mejor es utilizar material de archivo de origen que coincida con la frecuencia de fotogramas de la salida final. De esta forma, After Effects procesa todos los fotogramas y en la salida final no se omiten ni se duplican fotogramas. Si, aún así, la velocidad de fotograma del material de archivo de origen es algo distinta a lo que desea (por ejemplo, material de archivo de 30 fps y salida final de 29,97 fps), puede hacer que coincida con la velocidad de fotograma de la composición ajustándola.

El hecho de ajustar la frecuencia de fotogramas de un elemento de material de archivo no varía el archivo original, solamente la referencia que utiliza After Effects. Al ajustar, After Effects cambia la duración interna de los fotogramas pero no el contenido de éstos. Después, el material de archivo se reproduce a una velocidad distinta. Por ejemplo, si se ajusta la frecuencia de fotogramas de 15 fps a 30 fps, el material de archivo se reproduce el doble de rápido. En la mayoría de casos, ajuste la velocidad de fotogramas solamente cuando la diferencia entre la velocidad de fotogramas del material de archivo y la de la salida sea pequeña.

Puede cambiar la velocidad de fotogramas de cualquier película o secuencia de imágenes fijas. Por ejemplo, puede importar una secuencia de diez imágenes fijas y especificar una velocidad de fotogramas para cada elemento de material de archivo de 5 fotogramas por segundo (fps); entonces, esta secuencia tendría una duración de dos segundos cuando se utilizase en una composición.

La velocidad de fotogramas de la composición debe coincidir con la del formato del resultado final. En la mayoría de los casos, simplemente ha de seleccionar un ajuste de composición preestablecido. En cambio, ajuste la velocidad de fotogramas para cada elemento de material de archivo a la del material de archivo de origen inicial.